L'agriculture maraîchère sur petites surfaces au Québec : portrait et impact environnemental

L’objectif de cet essai est d’établir un portrait de l’agriculture maraîchère sur petites surfaces au Québec. Cette forme d’agriculture existe depuis un peu plus d’une vingtaine d’années dans la province. Une partie importante de ces fermes fait partie du réseau de fermiers de famille d’Équiterre qui nourrit plus de 52 000 personnes annuellement grâce à la distribution de paniers biologiques. Il y aurait environ 150 fermes maraîchères sur petites surfaces au Québec en 2016. Ces fermes se caractérisent par un système de production biologique, une mise en marché par circuits courts, des aliments non transformés et sans emballage cultivés sur de petites surfaces et une grande productivité. Il existe de nombreuses politiques et ressources pertinentes qui contribuent, dans leur ensemble, à soutenir cette forme d’agriculture. L’étude des impacts environnementaux de ces fermes s’est effectuée à travers leurs caractéristiques distinctives. Le constat principal sur le sujet est que les impacts environnementaux du système alimentaire sont substantiels. Les pratiques agricoles, le transport des aliments, leur réfrigération, leur transformation, l’utilisation d’emballage sont des aspects qui contribuent tous à l’émission de gaz à effet de serre et à la consommation d’énergie. Or, ces fermes mettent en marché des fruits et légumes biologiques non transformés et sans emballage par circuits courts. Il semble raisonnable d’avancer que ces aspects contribuent à réduire substantiellement leurs impacts environnementaux. Leur productivité permet de réduire les superficies requises pour produire une quantité donnée d’aliments, ce qui a le potentiel de retourner une partie des terres à leur état naturel. Cette possibilité pourrait être bénéfique pour la biodiversité, mais également pour capter une plus grande quantité de gaz à effet de serre de l’atmosphère. Cette forme d’agriculture fait face à de nombreux défis dont la concurrence avec d’autres producteurs de fruits et légumes au Québec et à l’étranger dans un contexte où le climat québécois ne permet pas de produire sur une année entière. La question demeure à savoir si les fermes maraîchères sur petites surfaces peuvent continuer à prendre de l’ampleur au Québec ou si elles resteront un phénomène relativement marginal. Le concept phare sur lequel les décideurs publics devraient s’appuyer pour élaborer leurs politiques publiques est celui des externalités. En internalisant les externalités négatives et positives générées par la production d’aliments, mais également par l’ensemble du système alimentaire, cela permettrait de révéler le prix réel des aliments consommés. Dans un tel monde, le prix des aliments d’origine végétale, biologique, non transformés, sans emballage et locaux aurait probablement tendance à être relativement moins élevé que celui des aliments nécessitant l’utilisation de plus de ressources. Les décideurs publics sont invités à corriger cette « défaillance du marché » présent dans le système alimentaire. Il est probable que les fermes maraîchères sur petites surfaces seraient les premières bénéficiaires de ces ajustements, car tout indique qu’elles produisent et mettent en marché leurs produits d’une manière qui est très respectueuse pour l’environnement

Intellektuaalse eliidi loomine teaduses ja tööstuses : (kõne) = La formation des élites intellectuelles dans la science et l'industrie : (conférence)

Digiteeritud Euroopa Regionaalarengu Fondi rahastusel, projekti "Eesti teadus- ja õppekirjandus" (2014-2020.12.03.21-0848) raames.https://www.ester.ee/record=b1140981*es

Unveiling Candida albicans intestinal carriage in healthy volunteers: the role of micro- and mycobiota, diet, host genetics and immune response

Candida albicans; Colonization resistance; MetagenomicsCandida albicans; Resistència a la colonització; MetagenòmicaCandida albicans; Resistencia a la colonización; MetagenómicaCandida albicans is a commensal yeast present in the gut of most healthy individuals but with highly variable concentrations. However, little is known about the host factors that influence colonization densities. We investigated how microbiota, host lifestyle factors, and genetics could shape C. albicans intestinal carriage in 695 healthy individuals from the Milieu Intérieur cohort. C. albicans intestinal carriage was detected in 82.9% of the subjects using quantitative PCR. Using linear mixed models and multiway-ANOVA, we explored C. albicans intestinal levels with regard to gut microbiota composition and lifestyle factors including diet. By analyzing shotgun metagenomics data and C. albicans qPCR data, we showed that Intestinimonas butyriciproducens was the only gut microbiota species whose relative abundance was negatively correlated with C. albicans concentration. Diet is also linked to C. albicans growth, with eating between meals and a low-sodium diet being associated with higher C. albicans levels. Furthermore, by Genome-Wide Association Study, we identified 26 single nucleotide polymorphisms suggestively associated with C. albicans colonization. In addition, we found that the intestinal levels of C. albicans might influence the host immune response, specifically in response to fungal challenge. We analyzed the transcriptional levels of 546 immune genes and the concentration of 13 cytokines after whole blood stimulation with C. albicans cells and showed positive associations between the extent of C. albicans intestinal levels and NLRP3 expression, as well as secreted IL-2 and CXCL5 concentrations. Taken together, these findings open the way for potential new interventional strategies to curb C. albicans intestinal overgrowth.This work was supported by a grant from Agence Nationale de la Recherche (FunComPath ANR-14-IFEC-0004), the French Government’s Investissement d’Avenir program (Laboratoire d’Excellence Integrative Biology of Emerging Infectious Diseases [ANR10-LABX-62-IBEID], and [ANR-10-LABX-69-01]), the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program under the Marie Sklodowska-Curie action, Innovative Training Network (FunHoMic; Grant No. 812969), and the European Union’s Horizon 2020 Research and Innovation Program (HDM-FUN, Grant No. 847507). AWW and the Rowett Institute (University of Aberdeen) received core funding support from the Scottish Government’s Rural and Environmental Sciences and Analytical Services (RESAS)

Involvement of DnaE, the second replicative DNA polymerase from Bacillus subtilis, in DNA mutagenesis

In a large group of organisms including low G + C bacteria and eukaryotic cells, DNA synthesis at the replication fork strictly requires two distinct replicative DNA polymerases. These are designated pol C and DnaE in Bacillus subtilis. We recently proposed that DnaE might be preferentially involved in lagging strand synthesis, whereas pol C would mainly carry out leading strand synthesis. The biochemical analysis of DnaE reported here is consistent with its postulated function, as it is a highly potent enzyme, replicating as fast as 240 nucleotides/s, and stalling for more than 30 s when encountering annealed 5'-DNA end. DnaE is devoid of 3' --> 5'-proofreading exonuclease activity and has a low processivity (1-75 nucleotides), suggesting that it requires additional factors to fulfill its role in replication. Interestingly, we found that (i) DnaE is SOS-inducible; (ii) variation in DnaE or pol C concentration has no effect on spontaneous mutagenesis; (iii) depletion of pol C or DnaE prevents UV-induced mutagenesis; and (iv) purified DnaE has a rather relaxed active site as it can bypass lesions that generally block other replicative polymerases. These results suggest that DnaE and possibly pol C have a function in DNA repair/mutagenesis, in addition to their role in DNA replication

Dynamics of stick-slip in peeling of an adhesive tape

We investigate the dynamics of peeling of an adhesive tape subjected to a constant pull speed. We derive the equations of motion for the angular speed of the roller tape, the peel angle and the pull force used in earlier investigations using a Lagrangian. Due to the constraint between the pull force, peel angle and the peel force, it falls into the category of differential-algebraic equations requiring an appropriate algorithm for its numerical solution. Using such a scheme, we show that stick-slip jumps emerge in a purely dynamical manner. Our detailed numerical study shows that these set of equations exhibit rich dynamics hitherto not reported. In particular, our analysis shows that inertia has considerable influence on the nature of the dynamics. Following studies in the Portevin-Le Chatelier effect, we suggest a phenomenological peel force function which includes the influence of the pull speed. This reproduces the decreasing nature of the rupture force with the pull speed observed in experiments. This rich dynamics is made transparent by using a set of approximations valid in different regimes of the parameter space. The approximate solutions capture major features of the exact numerical solutions and also produce reasonably accurate values for the various quantities of interest.Comment: 12 pages, 9 figures. Minor modifications as suggested by refere